港口与航运系目前开设有两个专业，即航海技术专业和轮机工程技术专业。有近40余年的水上办学经验，曾开办过船舶驾驶、船舶轮机、船舶电工、水运企业管理等专业，是湖北省主要的水运类学校之一，也是省内最大的内河船员培训单位，为湖北乃至全国的水上运输输送了大量的人才。近年来，港口与航运系从内河扩展到海洋，相继开办了基本安全，精通艇筏、值班机工、值班水手的培训，2004年开始航海类高职招生。
    港口与航运系目前有专业老师22 名，其中高级职称教师有7 名，中级职称教师有8 名，初级职称教师7 名，有12名教师具有水上专业资格证书，是双师型人才；而且聘请了多名专家作为兼职教师，具备了较为雄厚的教学力量。
    港口与航运系拥有大量的培训设备。如非机动救生艇6艘、机动救助艇1艘、机动救生艇1艘、模拟消防舱和大桅等。同时建有多个专业实习实训室。航海技术专业拥有航海仪器实训室、雷达模拟器实训室、海图作业实训室、GMDSS模拟实训室、水手工艺实训室、操舵模拟实训室、救生艇筏陈列室和水上训练基地；轮机工程技术专业有动力装置实训室、辅机实训室、金工实习室和模拟船舶电站。
    在长期的办学过程中，我院与水运企业建立了良好的校企关系，建立了多个的实习基地，如：华中航运集团，广东清远集团公司，上海南湾集团公司。这些实习基地为培养学生的实践操作技能提供了良好的条件，培养了大批水运人才。
    经济快速发展推动了航运业的快速发展，航运业的快速发展造成水运人才的供不应求。国家人力资源部的一项调研报告指出，到2010年，全球高级船员的短缺人数将达到4.6万。由此可见，本系两个专业的就业前景十分看好。